Ιδρύθηκε στην Σάμο το 1975 και στεγάζεται πλέον στο Πολιτιστικό-Εκκλησιαστικό Κέντρο της Μητρόπολης του 2006. Τα εκθέματα της συλλογής προέρχονται από μοναστήρια και εκκλησίες της Σάμου και της Ικαρίας, και περιλαμβάνουν εικόνες, άμφια, σκεύη, βιβλία, έργα αργυροχρυσοχοΐας, έργα υφαντικής και έργα ξυλογλυπτικής. Ξεχωρίζουν ο αρχιερατικός μανδύας του πατριάρχη Γρηγορίου Ε, τα επιμανίκια του Χρυσοστόμου Σμύρνης και μια εικόνα του 17ου αιώνα φιλοτεχνημένη από τον Θεόδωρο Πουλάκη.